Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Filip1Q9CS72 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Filip1Q9CS72 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Filip1Q9CS72 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Filip1Q9CS72 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Filip1Q9CS72 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Filip1Q9CS72 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms