Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klhl28Q9CR40 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Klhl28Q9CR40 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms