Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tma16Q9CR02 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms