Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp5f1Q9CQQ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Atp5f1Q9CQQ7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp5f1Q9CQQ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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