Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Chchd5Q9CQP3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Chchd5Q9CQP3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms