Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Higd2aQ9CQJ1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd2aQ9CQJ1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms