Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms