Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms