Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms