Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp2Q9CQ73 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms