Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4921530L21RikQ9CQ47 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms