Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Chmp3Q9CQ10 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Chmp3Q9CQ10 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms