Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nsmce3Q9CPR8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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