Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bhlhe41Q99PV5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Bhlhe41Q99PV5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms