Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtf2a1Q99PM3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms