Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scd3Q99PL7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scd3Q99PL7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms