Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Smim3Q99PE5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smim3Q99PE5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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