Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trem2Q99NH8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trem2Q99NH8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms