Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcgf6Q99NA9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcgf6Q99NA9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms