Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms