Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrrtQ99MR6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms