Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkd1Q99MH6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkd1Q99MH6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms