Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp1b4Q99ME6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp1b4Q99ME6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms