Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprtQ99M80 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprtQ99M80 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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