Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cdk5rap3Q99LM2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms