Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp16Q99LG0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp16Q99LG0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms