Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pagr1aQ99L02 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pagr1aQ99L02 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms