Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q99KU6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q99KU6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Q99KU6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q99KU6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q99KU6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q99KU6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms