Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ddb2Q99J79 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ddb2Q99J79 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms