Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf112Q96DY5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms