Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn16Q925N4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn16Q925N4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn16Q925N4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn16Q925N4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn16Q925N4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn16Q925N4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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