Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atad3Q925I1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms