Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nrif1Q923B3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nrif1Q923B3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms