Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trim59Q922Y2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim59Q922Y2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms