Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prpf3Q922U1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prpf3Q922U1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms