Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TardbpQ921F2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms