Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smarca5Q91ZW3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smarca5Q91ZW3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms