Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Grin3bQ91ZU9 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms