Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nek8Q91ZR4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms