Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Synpo2Q91YE8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Synpo2Q91YE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms