Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pcdha8Q91Y12 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pcdha8Q91Y12 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms