Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx15Q91WE1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx15Q91WE1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx15Q91WE1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms