Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tdrd3Q91W18 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd3Q91W18 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms