Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zkscan3Q91VW9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zkscan3Q91VW9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms