Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps4aQ8VEJ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps4aQ8VEJ9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms