Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Slc6a20aQ8VDB9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc6a20aQ8VDB9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc6a20aQ8VDB9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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