Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX6

Kptn, KICSTOR complex protein kaptin, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KptnQ8VCX6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KptnQ8VCX6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
KptnQ8VCX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms