Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nae1Q8VBW6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nae1Q8VBW6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms