Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cops8Q8VBV7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cops8Q8VBV7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms