Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2D1

Vmn1r22, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r22Q8R2D1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r22Q8R2D1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms